众所周知，真核生物细胞含有一些高丰度RNA，其中含量最高的是核糖体RNA（rRNA），而血液的RNA中含量第二高的就是珠蛋白（globin）RNA。这两种RNA占血液样本总RNA的85%以上。

如果不进行处理就建库测序，高丰度RNA占据着大量的数据，不仅浪费了测序成本，更淹没了目标RNA的数据，特别是一些低丰度但起着关键调控的RNA或者是罕见融合位点，使我们难以比较表达的差异化和特异性。

利用mRNA的polyA尾特点来富集mRNA的方法，虽然可以去除核糖体RNA，但并不能去除globin mRNA，同时其它的非编码RNA的品种也会一并丢失。另外，在RNA样本的质量不高时，由于降解导致polyA尾的不完整，这种方法也不适用。

RNA酶H法的原理：rRNA及globin RNA与特异互补的DNA寡核苷酸链杂交，接着与DNA链杂交的RNA品种被RNA酶H特异消化去除，引入的DNA链则通过后续的DNA酶消化而去除。